【2025年】ネットショップ向け在庫管理システム比較!選び方と導入メリット


先週、楽天で注文が入った商品が、実はAmazonではすでに売り切れ…。在庫ズレが発生して、慌ててキャンセル対応しました。在庫ズレを防ぐ良い方法はないですか?

それなら、ネットショップ向けの「在庫管理システム」を導入するのがおすすめです。複数のECサイトと連携できるシステムなら、在庫を一元管理できますよ。
- 「在庫があるはずなのに欠品していた…」
- 「気づいたら在庫切れで販売チャンスを逃していた…」
- 「売れたはずの商品が、実は在庫数の更新ミスで重複販売されていた…」
こんな経験はありませんか?
ネットショップの運営では、在庫管理のミスが売上にも信用にも直結します。特に、複数のECモールや自社サイトを運営している場合、手作業での在庫管理には限界があります。
そこで、活用したいのが ネットショップ向けの在庫管理システムです。在庫更新の自動化、複数チャネルの一元管理、売上分析など、業務効率を大幅に向上させる機能が豊富に揃っています。

本記事では、ネットショップ向けの在庫管理システムである「助ネコEC管理システム」を提供している私達が、2025年最新版のネットショップ向け在庫管理システムを徹底比較!導入のメリットや選び方のポイントを詳しく解説します。
目次(クリックで移動)
ネットショップに在庫管理システムが必要な理由

ネットショップの運営において、在庫管理はビジネスの成功を左右する重要な要素です。在庫管理システムの導入が必要なのは、以下の理由があるからです。
- 在庫ズレが売上に直結する
- 人的ミスを削減し、業務効率化
- 売れ筋商品の在庫補充を最適化
在庫ズレが売上に直結する
ネットショップを運営していると、楽天では在庫があるのに、Amazonではすでに売り切れというケースが発生します。この状態で注文が入ってしまうと、注文キャンセルやクレームにつながり、信頼低下の原因になります。
ネットショップ向けの在庫管理システムを導入すれば、各ECモールやカートと連携し、在庫情報を自動で更新 できるので、在庫ズレを事前に防げます。
人的ミスを削減し、業務効率化
手動での在庫管理は、エクセルやGoogleスプレッドシートを使ってもミスが発生しやすいものです。在庫管理システムを導入すれば、販売と同時に在庫数を自動調整 できるので、人的ミスを削減できます。
売れ筋商品の在庫補充を最適化
ネットショップ向けの在庫管理システムを活用することで、売れ筋商品の在庫状況をリアルタイムで把握し、機会損失を防ぐことが可能になります
データを分析することで、適切な在庫補充のタイミングを見極めることができ、売上アップにつながります。
2025年最新!ネットショップ向け在庫管理システム比較

ここでは、2025年最新のネットショップ向け在庫管理システム5選を紹介し、それぞれの特徴を比較します。
システム名 | 提供形態 | 料金プラン | 特徴 |
---|---|---|---|
助ネコEC管理システム | クラウド型 | 月額21,000円 連携サイト数&取込件数&商品点数の上限なしで 料金固定! | 直感的な操作性と多機能性が魅力。ECサイトとの連携が充実。 |
ロジクラ | クラウド型 | 月額14,800円~ | シンプルな操作で中小企業向け。スマホアプリ対応。 |
ZAICO(ザイコ) | クラウド型 | 月額3,980円~ | スマホで簡単に在庫管理が可能。低コストで導入しやすい。 |
GoQSystem(ゴクーシステム) | クラウド型 | 月額29,800円~ | 受注・在庫連携管理のセットプラン |
アラジンオフィス | オンプレミス型・クラウド型 | 個別見積り | 幅広い業種に対応。柔軟なカスタマイズが可能。 |
1. 助ネコEC管理システム

- 特徴:多機能かつ操作が簡単なクラウド型システム。受注管理、在庫管理、商品登録、発注管理など幅広い機能を備えています。初心者でも使いやすい設計で、ECサイトとの連携も充実。
- おすすめポイント:直感的な操作性・ECサイトとのスムーズな連携
- 料金:月額21,000円(連携サイト数&取込件数&商品点数の上限なしで完全固定!)
2. ロジクラ

- 特徴:中小企業や個人事業主向けの在庫管理システム。スマホアプリから簡単に管理でき、バーコードスキャン機能も搭載。
- おすすめポイント:シンプルな操作・スマホアプリ対応
- 料金:月額14,800円~
3. ZAICO(ザイコ)

- 特徴:スマホやタブレットから操作できるクラウド型在庫管理システム。低コストで導入でき、初心者でも使いやすい。小規模ECサイトや倉庫管理にも適しています。
- おすすめポイント:低コスト・スマホ管理対応
- 料金:月額3,980円~
4. GoQSystem(ゴクーシステム)

- 特徴:無料プランありの在庫管理システム。ECサイトとの受注管理や在庫連携が強みで、複数のネットショップを運営する事業者向け。
- おすすめポイント:無料プランあり・受注管理が強み
- 料金:月額29,800円~
5. アラジンオフィス

- 特徴:オンプレミス型、クラウドサービス型のどちらにも対応した、幅広い業種のニーズに応える高機能パッケージシステム。
- おすすめポイント:幅広い業種に対応・柔軟なカスタマイズ
- 料金:個別見積り
ネットショップ向け在庫管理システムの選び方

ネットショップの運営において、在庫管理システムの導入は業務効率の向上や販売機会の最大化に直結します。
しかし、さまざまなシステムが存在するため、どれを選べばいいのか迷うこともあるでしょう。ここでは、ネットショップ向け在庫管理システムを選ぶ際のポイントを解説します。
どのECモール・カートと連携できるか?
楽天市場・Amazon・メルカリShops・BASE・Shopify など、利用している販売チャネルとネットショップ向け在庫管理システムが連携可能かどうかを確認しましょう。
「助ネコEC管理システム」の対応モール・カート一覧はこちら>>
料金プランの比較
ネットショップ向け在庫管理システムには、月額固定プラン・従量課金プラン があります。売上規模や運営スタイルに応じて、コストと機能のバランスを考えて選びましょう。
3-3. 使いやすさとサポート体制
ネットショップ向け在庫管理システムの導入後、使いこなせるかどうかが重要です。無料トライアルを活用して、操作性やサポートの充実度をチェックしましょう。
まとめ:ネットショップ向け在庫管理システムを比較して最適なものを選ぼう!

ネットショップにおける在庫管理のミスは、売上の機会損失や顧客満足度の低下につながります。
手動管理の限界を感じているなら、ネットショップ向けの在庫管理システムを導入するのがベスト です。
2025年おすすめのネットショップ向け在庫管理システム
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在庫ズレのストレスから解放され、ネットショップ運営がスムーズになります。